Σύμφωνα με το Νόμο 4449/2017, όπως ισχύει, η δομή της Επιτροπής Ελέγχου, καθώς και ο αριθμός και η ιδιότητα των μελών της, αποφασίζονται από τη Γενική Συνέλευση των Μετόχων. Τα μέλη της Επιτροπής ορίζονται από το Δ.Σ. ή την Ετήσια Γενική Συνέλευση της Τράπεζας, κατόπιν εισήγησης της Επιτροπής Εταιρικής Διακυβέρνησης και Υποψηφιοτήτων. Ο/Η Πρόεδρος και ο/η Αντιπρόεδρος της Επιτροπής ορίζονται από τα μέλη της Επιτροπής. Η Επιτροπή αποτελείται από τουλάχιστον τρία μη εκτελεστικά μέλη του Δ.Σ., το 75% δε αυτών (στρογγυλοποιημένο στον πλησιέστερο ακέραιο) είναι ανεξάρτητα μέλη Δ.Σ. σύμφωνα με τον ορισμό της ανεξαρτησίας που περιλαμβάνεται στο σχετικό πλαίσιο, ιδίως στο άρθρο 9 του Ν. 4706/2020, στην ΠΕΕ 224/2023 και στον Κώδικα Εταιρικής Διακυβέρνησης της Τράπεζας.
Σύμφωνα με την απόφαση της Tακτικής Γενικής Συνέλευσης των Μετόχων της 25.07.2024, η Επιτροπή Ελέγχου παραμένει Επιτροπή του Διοικητικού Συμβουλίου. Η θητεία των μελών της Επιτροπής που θα οριστούν από το Διοικητικό Συμβούλιο σύμφωνα με το άρθρο 44 παρ. 1 περίπτωση γ' του Ν. 4449/2017 ακολουθεί τη θητεία τους ως μέλη του Διοικητικού Συμβουλίου, δηλαδή μέχρι την Τακτική Γενική Συνέλευση του έτους 2027 και, σε κάθε περίπτωση, λήγει αυτοδικαίως εάν παύσουν να είναι μέλη του Διοικητικού Συμβουλίου της ΕΤΕ. Τα μέλη της Επιτροπής πληρούν τα κριτήρια καταλληλότητας/προσόντα που ορίζονται στο άρθρο 44 του Ν. 4449/2017, καθώς και στον Κανονισμό Λειτουργίας της Επιτροπής Ελέγχου. Η Επιτροπή συνεδριάζει τακτικά τουλάχιστον έξι φορές ετησίως ή έκτακτα, όποτε παρίσταται ανάγκη, τηρεί πρακτικά των συνεδριάσεών της και υποβάλλει αναφορές στο Διοικητικό Συμβούλιο κάθε τρεις μήνες ή συχνότερα εφόσον κριθεί αναγκαίο..
Ο Κανονισμός Λειτουργίας της Επιτροπής αναθεωρήθηκε τον Μάιο του 2023.